Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SHPRHQ149N8 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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SHPRHQ149N8 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SHPRHQ149N8 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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SHPRHQ149N8 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SHPRHQ149N8 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SHPRHQ149N8 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SHPRHQ149N8 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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