Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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