Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms