Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms