Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCINQ13939 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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CCINQ13939 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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CCINQ13939 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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CCINQ13939 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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CCINQ13939 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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CCINQ13939 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCINQ13939 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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CCINQ13939 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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