Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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