Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.56□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms