Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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