Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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SP140Q13342 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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SP140Q13342 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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SP140Q13342 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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SP140Q13342 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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