Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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