Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms