Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms