Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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