Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA2O43364 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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