Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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