Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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