Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FANCFQ9NPI8 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms