Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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TTC9Q92623 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTC9Q92623 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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