Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf40Q8IXQ3 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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C9orf40Q8IXQ3 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf40Q8IXQ3 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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