Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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