Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms