Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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