Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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