Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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