Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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