Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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