Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL4A6Q14031 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL4A6Q14031 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms