Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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