Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms