Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms