| RUNX3 | Q13761 | AC009318.4-201 | ENST00000620496 | 486 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PROX1-AS1-244 | ENST00000630355 | 599 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FRS2-201 | ENST00000397997 | 6550 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL021368.2-201 | ENST00000606125 | 5352 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRKACB-217 | ENST00000610457 | 4206 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRKACB-218 | ENST00000610703 | 4240 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF804B-202 | ENST00000611114 | 3968 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRV1-201 | ENST00000405460 | 19557 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CPNE8-202 | ENST00000360449 | 1757 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1-204 | ENST00000399489 | 1727 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRTM2-201 | ENST00000274711 | 6017 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFHR4-201 | ENST00000251424 | 1292 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STARD6-201 | ENST00000307844 | 663 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00301-201 | ENST00000320202 | 852 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MT-ATP6-201 | ENST00000361899 | 681 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD116-1-201 | ENST00000384335 | 95 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EI24P2-201 | ENST00000397776 | 1076 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP45-201 | ENST00000402289 | 315 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL021407.1-201 | ENST00000404531 | 386 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL078590.1-201 | ENST00000412602 | 479 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RPL29P29-201 | ENST00000448725 | 423 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL392046.1-203 | ENST00000450106 | 651 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SATB1-AS1-204 | ENST00000453361 | 726 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P30-201 | ENST00000457863 | 606 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108078.3-201 | ENST00000502633 | 489 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02462-201 | ENST00000503009 | 430 nt | TSL 5 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5H5P-201 | ENST00000503164 | 928 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105313.1-201 | ENST00000509121 | 353 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CTD-2350J17.1-201 | ENST00000509228 | 362 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIGD1AP13-201 | ENST00000509878 | 289 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093281.2-201 | ENST00000510153 | 597 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO3P44-201 | ENST00000510977 | 541 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02500-201 | ENST00000512547 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCARNA20.6-201 | ENST00000517251 | 106 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | COX6CP8-201 | ENST00000522620 | 226 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB131D-201 | ENST00000526803 | 184 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR7K1P-201 | ENST00000546439 | 926 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP2-201 | ENST00000558168 | 301 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005205.1-201 | ENST00000563503 | 508 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003687.1-201 | ENST00000578040 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4637-201 | ENST00000582405 | 84 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC135012.2-201 | ENST00000600234 | 479 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC243773.3-201 | ENST00000613270 | 256 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | 5S_rRNA.12-201 | ENST00000617631 | 107 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RBM12B-AS1-201 | ENST00000623283 | 653 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091965.5-201 | ENST00000624785 | 342 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003399.1-201 | ENST00000637534 | 361 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U6.101-201 | ENST00000637707 | 76 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LUZP2-208 | ENST00000620308 | 4981 nt | TSL 5 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TANK-201 | ENST00000259075 | 2152 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SYNE2-212 | ENST00000554584 | 20508 nt | TSL 5 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KYNU-202 | ENST00000375773 | 1772 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SERPINI2-201 | ENST00000264677 | 1678 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRDN-201 | ENST00000334268 | 4770 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P23-201 | ENST00000415223 | 1526 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1D-201 | ENST00000355848 | 2233 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WDR72-201 | ENST00000360509 | 5887 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138915.3-201 | ENST00000562908 | 1389 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WDR49-201 | ENST00000308378 | 2594 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UGT2B10-201 | ENST00000265403 | 1931 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C8orf59-201 | ENST00000321777 | 325 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002088.1-201 | ENST00000382740 | 395 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-37P-201 | ENST00000410695 | 177 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC013286.1-201 | ENST00000412137 | 381 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LANCL1-AS1-201 | ENST00000416344 | 714 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL645937.1-202 | ENST00000421799 | 937 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005517.2-201 | ENST00000424673 | 553 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01799-202 | ENST00000426260 | 625 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | INTS6L-AS1-201 | ENST00000430820 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161935.3-201 | ENST00000433770 | 347 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS20P5-201 | ENST00000434808 | 360 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139237.2-201 | ENST00000438454 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND2P4-201 | ENST00000445034 | 1004 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EEF1E1P1-201 | ENST00000446998 | 430 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND2P19-201 | ENST00000449129 | 1012 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC16A12-AS1-202 | ENST00000454270 | 478 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPG-206 | ENST00000454893 | 527 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO3P11-201 | ENST00000455103 | 774 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANKRD62P1-PARP4P3-201 | ENST00000456726 | 1181 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026410.2-201 | ENST00000460281 | 156 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010468.1-201 | ENST00000461022 | 817 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RC3H2-207 | ENST00000471874 | 749 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ST13P14-201 | ENST00000474095 | 734 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KC877373.1-201 | ENST00000479066 | 408 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL20P-201 | ENST00000488827 | 297 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP6V1G3-204 | ENST00000489986 | 449 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108752.1-203 | ENST00000496674 | 339 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPF2P2-201 | ENST00000504693 | 896 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |