Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCGB2A2Q13296 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms