Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
NME3Q13232 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
NME3Q13232 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms