Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms