Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms