Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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