Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NFX1Q12986 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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