Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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