Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TROQ12816 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TROQ12816 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TROQ12816 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TROQ12816 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TROQ12816 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TROQ12816 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TROQ12816 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TROQ12816 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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