Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms