Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EPHB4P54760 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms