Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRMP28827 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRMP28827 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRMP28827 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRMP28827 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRMP28827 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRMP28827 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRMP28827 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRMP28827 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRMP28827 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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