Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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