Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms