Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PARP3Q9Y6F1 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms