Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC88CQ9P219 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms