Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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