Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TMX3Q96JJ7 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TMX3Q96JJ7 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms