Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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