Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms