Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms